年次大会
総会並びに研究発表会を開催します（4月～5月）。

ワークショップ
専門家を招いてその菌類の専門分野の採集から同定までを勉強します。通常２泊３日で行います（6月～10月）。

サマースクール
菌類の専門家による子供のためのサマースクールを開催します（7月～8月）。

菌類観察会
キノコや微小菌類の採集会です。通常１泊２日で行います（9月～10月）。

菌学シンポジウム
あるテーマで専門家を招待し、そのテーマを深く掘り起こし、解りやすく解説してもらいます（12月）。

夏の集い/冬の集い
菌類との関係が深い産業と言えば、お酒造りです。ビール工場や酒造の見学を行いながら、会員どうしの交流を深めるという行事を行いました。 （平成12～16年、28年に開催）。